L‘ingresso in Via Portica, 2 da accesso alla cripta della demolita Chiesa di S. Nicolò, dove il Museo espone reperti umbri e romani, in particolare cippi, urne funerarie e lapidi.

Conserva altresì il muro di fondo della grande terrazza, sulla quale fu edificato il Tempio di Minerva in Piazza del Comune e le lastre calcaree di pavimentazione romana.

Un cunicolo porta sotto alla Piazza del Comune, al cosiddetto foro romano (che invece si trovò piuttosto nell‘area della Cattedrale di S. Rufino).

Oltre alle scale che dalla grande terrazza di 85 x 45 metri portarono all‘ulteriore terrazzamento sul quale poggia il tempio, in asse all‘ingresso di questi, è stata scoperta la base di un tetrastilo che secondo un iscrizione conteneva un gruppo scultureo di Castore e Polluce.

Una situazione analoga si trova al Palatino a Roma, davanti al tempio di Apollo.